操作和使用方法
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原理: 核酸在高盐条件下与硅胶膜结合,在低盐、高PH值时核酸从硅胶膜上洗脱下来,经过多次离心转管收集
优点: 纯度高;成本较低。
缺点: 需多次高速离心 ,操作步骤多;负压抽吸,开放式操作,效率低 ,易形成交叉污染;
吸附柱会出现堵塞现象;回收率低,损失量大,不适合小片段提取;不同试剂保存条件不一致 ,易丢失。
方法三:磁珠法
原理: 精制的超顺磁纳米硅磁珠在盐溶液条件下特异性吸附血液中的游离核酸,将吸附核酸的磁珠转移至低盐等条件下将其洗脱下来 。
优点: 纯度高;回收率高,小片段同样可纯化;可自动化操作。
缺点: 国外进口试剂成本高。
1. 检测cfDNA片段大小
a)利用凝胶电泳检测 ,但是不能精确检测片段大小;
b)利用qPCR检测, 但只能检测事先选定的位点,并不适合基因组范围的分析;
c)利用电镜检测, 但费时费力,效率低;
d)利用大规模测序平台检测;
2. cfDNA相关的分子检测
利用计算窗口化保护评分(windowedprotectionscore ,缩写wps)进行检测,即:片段大小=在基因组里面一个特殊的点内跨越120bp的DNA片段数量-有端点的片段的数量 。它和核小体距离有相关性。我们可以根据核小体的距离来推测cfDNA的来源。
3. 检测目
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评论列表(4条)
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