操作和使用方法
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a)利用凝胶电泳检测,但是不能精确检测片段大小;
b)利用qPCR检测, 但只能检测事先选定的位点,并不适合基因组范围的分析;
c)利用电镜检测, 但费时费力 ,效率低;
d)利用大规模测序平台检测;
2. cfDNA相关的分子检测
利用计算窗口化保护评分(windowedprotectionscore,缩写wps)进行检测,即:片段大小=在基因组里面一个特殊的点内跨越120bp的DNA片段数量-有端点的片段的数量 。它和核小体距离有相关性。我们可以根据核小体的距离来推测cfDNA的来源。
3. 检测目的
a)检测cfDNA的大小可以知道它是由哪种细胞死亡机制产生的:~10000bp的cfDNA由细胞坏死产生;140-200bp的cfDNA由细胞凋亡产生;313-798bp的为孕妇cfDNA;
b)检测 cfDNA相关分子信号 ,比如甲基化,以及核小体距离可以追溯它的组织来源;
c)检测特定序列的cfDNA的种类数量的变化可以判断癌症,以及相关疾病 。
血中cfDNA在疾病的早期诊断、预后、监测等方面具有重要潜在价值。其具体医学应用大致包括以下方面:
a)用于产前诊断;
b) 用于免疫性疾病等非肿瘤类疾病的病情分析与疗效观察;
c)用于肿瘤相关分析。
在上述三类应用中 ,其在肿瘤分析中的价值尤为重要,虽然目前血中cfDNA分析尚未列为临床必需的检测指标,但数以千计的研究论文和大量一期和二期临床试验的数据 ,有力支持这一新技术在肿瘤防治中的巨大应用价值:
a)肿瘤的早期诊断;
b)肿瘤治疗方案确定;
c)肿瘤疗效观察;
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